Le Grand Prix moto de Malaisie 2009 est la seizième manche du championnat du monde de vitesse moto 2009. La compétition s'est déroulée du 23 au 25 octobre 2009 sur le circuit International de Sepang devant plus de 59 206 spectateurs. C'est la 19e édition du Grand Prix moto de Malaisie. Grâce à sa troisième place, Valentino Rossi s'est adjugé le titre de champion du monde MotoGP.