L'église de la Flagellation est une église catholique de la vieille ville de Jérusalem qui se trouve dans le quartier musulman près de la porte Saint-Étienne. Elle commémore la Flagellation du Christ. L'église se trouve à côté du couvent franciscain de la Flagellation. C'est la seconde station du chemin de Croix qui a lieu tous les vendredis dans la vieille ville.