La saison 1998 de Super 12 est la troisième édition de la compétition. Elle est disputée par 12 franchises d'Australie, d'Afrique du Sud et de Nouvelle-Zélande. La compétition débute le 27 février 1998 et se termine le 30 mai 1998 à Auckland. Elle est remportée par les Crusaders à l'issue d'une finale contre les Blues.