La saison 1958-1959 des FAR de Rabat est la toute première saison de l'histoire du club. Le club participe à la seconde division et est par ailleurs engagé en coupe du Trône. Mohamed Chtouki commence sa première saison en tant qu'entraîneur et devient donc le premier entraîneur du club militaire. Finalement, les FAR de Rabat terminent vainqueur face au Mouloudia d'Oujda en coupe du Trône le 14 décembre 1958 et remportent le championnat de deuxième division de la Poule Sud.