Francisco de Mendoza y Bobadilla (né à Cuenca en Espagne, le 25 septembre 1508 et mort à le 1er décembre 1566) est un cardinal espagnol du XVIe siècle. Il est de la famille des cardinaux Pedro González de Mendoza (1473), Diego Hurtado de Mendoza (1500) et Íñigo López de Mendoza y Zúñiga (1530).