L'abbaye de Clairefontaine en Franche-Comté est une abbaye cistercienne d'hommes qui a existé de 1131/1132 à 1791. Elle était située sur le territoire actuel de la commune de Polaincourt-et-Clairefontaine dans le département de la Haute-Saône et dépendait du diocèse de Besançon. Les bâtiments vendus comme bien national à la Révolution ont été transformés en faïencerie au XIXe siècle puis en hôpital psychiatrique à partir de 1938.