L'île du Havre Aubert est une des îles composant l'archipel des îles de la Madeleine au Québec. L'Île du Havre Aubert formait une municipalité à part entière jusqu'à son regroupement à d'autres municipalités des îles de la Madeleine en 2002 pour former Les Îles-de-la-Madeleine. Elle fut nommée ainsi en l'honneur du navigateur français Thomas Aubert.