Les élections au Parlement de La Rioja de 1999 (en espagnol : Elecciones al Parlamento de La Rioja de 1999) se sont tenues le dimanche 13 juin 1999 afin d'élire les trente-trois députés de la cinquième législature du Parlement de La Rioja. La victoire revient au Parti populaire de La Rioja (PPLR), qui obtient une nouvelle fois la majorité absolue des voix et des sièges.