Le tunnel de Choindez est un tunnel autoroutier à un tube parcouru par l'autoroute A16 et situé dans le canton du Jura en Suisse. Avec le tunnel du Raimeux il relie Courrendlin dans la vallée de Delémont à Moutier en traversant le Montchemin parallèlement à la cluse de Moutier. D'une longueur de 3 288 mètres, il est ouvert à la circulation depuis 2016.