Soyouz MS-01 (en russe : Союз МС-01) est une mission spatiale qui a débuté le 7 juillet 2016 et s'est terminée le 30 octobre suivant. Première mission de la nouvelle version MS du vaisseau Soyouz, elle transporte les trois membres de l'Expédition 48 vers la station spatiale internationale (ISS).