La saison 2012-2013 du Club sportif sfaxien est la 58e saison consécutive du club dans l'élite. Le club remporte son huitième titre de champion de Tunisie, mais perd en finale de la coupe de Tunisie face à l'Étoile sportive du Sahel. Le club se qualifie pour la phase de poule de la coupe de la confédération 2013.