Lors de la saison 2008-2009, le FC Sion évolue en Super League. La saison est marquée par un début en championnat relativement difficile durant laquelle deux changements d'entraineurs ont eu lieu. Le 13 avril 2009, Sion se qualifie pour sa 11e finale en coupe de Suisse et la remporte pour la 11e fois le 20 mai face à Young Boys.