La saison 2004 de Super 12 est la neuvième édition de la compétition. Elle est disputée par 12 franchises d'Australie, d'Afrique du Sud et de Nouvelle-Zélande. La compétition débute le 20 février 2004 et se termine le 22 mai 2004 à Canberra. Elle est remportée par les Brumbies à l'issue d'une finale contre les Crusaders.