La saison 1938-1939 du SO Montpelliérain a vu le club évoluer en Division 2 pour la quatrième saison consécutive. Le club héraultais va connaître une mauvaise saison en terminant à la 17e place du championnat. En Coupe de France, les somistes vont se rattraper en atteignant les quarts de finale de la compétition.