Le Major league Soccer 1999 est la 4e saison de la Major League Soccer, le championnat professionnel de football (soccer) des États-Unis. À noter que le Crew de Columbus devient au cours de cette année le premier club à être équipé de son propre stade, le Columbus Crew Stadium. Deux places qualificatives pour la Coupe des champions de la CONCACAF 2000 sont attribuées aux finalistes du championnat.