La Ligue des champions de la CAF 2006 est la 42e édition de la plus importante compétition africaine interclubs. Elle met aux prises les meilleurs clubs de football du continent africain. Il s'agit également de la 10e édition sous la dénomination Ligue des champions de la CAF. Le vainqueur du tournoi se qualifie pour la Coupe du monde des clubs de la FIFA 2006. Al Ahly SC remporte cette édition et conserve son titre en battant en finale le CS Sfax.