Les lignes spéciales ont pour vocation d'effectuer des services de remplacement en cas d'interruption momentanée ou temporaire d'une ligne de métro, funiculaire ou de tramway, soit pour des navettes spéciales comme le service Rotary ou lors des Nuits de Fourvière pour assurer pour transporter les spectateurs après la fin des concerts ou pour effectuer des dessertes scolaires avec les lignes Junior Direct.