Kenji Fukaya (深谷 賢治, Fukaya Kenji) est un mathématicien japonais né le 12 mars 1959. Il est connu pour ses travaux en géométrie symplectique et en géométrie riemannienne.Ses nombreuses contributions fondamentales aux mathématiques incluent la découverte de la catégorie de Fukaya. Il est membre permanent du corps professoral du et professeur de mathématiques à l'université de Stony Brook.