Jovan Stanković (en serbe en écriture cyrillique : Јован Станковић), né le 4 mars 1971 à Pirot en Yougoslavie (aujourd'hui en Serbie), est un footballeur international serbe qui évoluait au poste de milieu de terrain. Stanković n'a marqué aucun but lors de ses dix sélections avec l'équipe de RF Yougoslavie entre 1998 et 2000.