L'EKZ CrossTour 2016-2017 est la troisième édition de l’EKZ CrossTour. Il a lieu du 18 septembre 2016 à Baden au 2 janvier 2017 à Meilen. Elle comprend cinq manches masculines et féminines. Toutes les épreuves font partie du calendrier de la saison de cyclo-cross masculine 2016-2017 masculine et féminine.