La Coupe de la Ligue féminine de handball 2003-2004 est la 2e édition de la Coupe de la Ligue française féminine de handball. La phase finale de la compétition est organisée en Languedoc, du 26 au 28 décembre 2003. La compétition est remportée par l'ES Besançon qui réalise le doublé après sa victoire de la saison précédente. L'ES Besançon a battu Metz Handball en finale. Les deux autres demi-finalistes étaient Le Havre AC Handball et Toulon St-Cyr Var Handball.