La saison 2003 de Premier-Liga est la douzième édition de la première division russe. Lors de cette saison, le Lokomotiv Moscou a tenté de conserver son titre de champion de Russie face aux quinze meilleurs clubs russes lors d'une série de matchs se déroulant sur toute l'année. Chacun des seize clubs participant au championnat a été confronté à deux reprises aux quinze autres. Cinq places étaient qualificatives pour les compétitions européennes, la sixième place étant celles du vainqueur de la Coupe de Russie 2003-2004.