Le championnat de France féminin de handball 1999-2000 est la quarante-neuvième édition de cette compétition. Le championnat de Division 1 est le plus haut niveau du championnat de France de ce sport. Dix clubs participent à la compétition. À la fin de la saison, l'ASPTT Metz conserve son titre de champion de France. Metz remporte le neuvième championnat de son histoire en devançant l'ES Besançon.