Le championnat NCAA de basket-ball 2006 a réuni 65 équipes NCAA dans un tournoi du 14 mars 2006 au 3 avril 2006. Le Final Four s'est tenu du premier au 3 avril 2006 dans le RCA Dome à Indianapolis et a été remporté par les Gators de l'université de Floride. Joakim Noah a été élu Most Outstanding Player du tournoi.