Le Challenge de France féminin 2003-2004 est la 3e édition du Challenge de France féminin. Il s'agit d'une compétition à élimination directe ouverte à tous les clubs de football français ayant une équipe féminine, organisée par la Fédération française de football (FFF) et ses ligues régionales. La finale a eu lieu le 12 juin 2004 au Stade Alexandre-Cueille à Tulle, et a été remporté par le FC Lyon face à l'US Compiègne sur le score de deux buts à zéro.