La 3e édition du BeNe Ladies Tour a lieu du 15 juillet au 17 juillet 2016. La course fait partie du calendrier UCI féminin en catégorie 2.2. Jolien D'Hoore domine l'épreuve en gagnant trois des quatre étapes, dont celle contre-la-montre et en portant le maillot de leader du classement général du début à la fin. Elle remporte aussi le classement par points. Floortje Mackaij est deuxième du classement général et meilleure jeune. Élise Delzenne est troisième de l'épreuve. Enfin Nina Kessler gagne la deuxième étape.