La di-guanosine monophosphate cyclique, également appelée diguanylate cyclique, est un second messager utilisé par de nombreuses bactéries, mais ne semble pas être utilisé par les archées ni par les eucaryotes. La structure de cette molécule correspond à un minuscule fragment d'ARN cyclique à deux résidus guanine, liés par deux résidus ribose-5-phosphate, formant un cycle à deux nucléotides.Chez les bactéries, certains signaux sont transmis en produisant ou en dégradant de la di-GMP cyclique.

PropertyValue
dbpedia-owl:abstract
  • La di-guanosine monophosphate cyclique, également appelée diguanylate cyclique, est un second messager utilisé par de nombreuses bactéries, mais ne semble pas être utilisé par les archées ni par les eucaryotes. La structure de cette molécule correspond à un minuscule fragment d'ARN cyclique à deux résidus guanine, liés par deux résidus ribose-5-phosphate, formant un cycle à deux nucléotides.Chez les bactéries, certains signaux sont transmis en produisant ou en dégradant de la di-GMP cyclique. Celle-ci est synthétisée par des enzymes ayant une activité diguanylate cyclase, protéines possédant un motif Gly-Gly-Asp-Glu-Phe, séquence de cinq acides aminés conservée dans toutes ces protéines. La dégradation de la di-GMP cyclique est réalisée par des phosphodiestérases présentant des motifs Glu-Ala-Leu ou His-Asp-Xxx-Gly-Tyr-Pro. La formation des biofilms, la motilité, la production de certains polysaccharides extracellulaires et le comportement multicellulaire déterminant la virulence des germes sont des processus dont on sait qu'ils sont modulés notamment par la di-GMP cyclique, du moins chez certains organismes.La concentration intracellulaire de di-GMP cyclique est régulée à travers différents mécanismes. De nombreuses protéines présentant les séquences caractéristiques Gly-Gly-Asp-Glu-Phe, Glu-Ala-Leu ou His-Asp-Xxx-Gly-Tyr-Pro possèdent également d'autres domaines susceptibles de recevoir des signaux, tels que des domaines PAS. Les enzymes qui produisent ou dégradent la di-GMP cyclique se localiseraient dans des régions spécifiques des cellules, où elles agiraient sur les récepteurs au sein d'un volume réduit. La di-GMP cyclique est un inhibiteur allostérique de certaines diguanylate cyclases et d'une cellulose synthase à GDP de Gluconacetobacter xylinus. Chez cette dernière, la di-GMP cyclique se lie au domaine PilZ de la protéine, celui-ci étant vraisemblablement déterminant dans le processus de régulation.De récentes études ont établi que la structure des domaines PilZ de deux espèces de bactéries change complètement de conformation en se liant à la di-GMP cyclique,. Ces résultats suggèrent assez fortement que les changements de conformation des domaines PilZ jouent un rôle déterminant dans la régulation allostérique des enzymes cibles de la di-GMP cyclique.
  • Cyclic di-GMP (also called cyclic diguanylate and c-di-GMP) is a second messenger used in signal transduction in a wide variety of bacteria. Cyclic di-GMP is not known to be used by eukaryotes or archaea. The biological role of cyclic di-GMP was first uncovered when it was identified as an allosteric activator of a cellulose synthase found in Gluconacetobacter xylinus.In structure, it is a cycle containing only two guanine bases linked by ribose and phosphate.In bacteria, certain signals are communicated by synthesizing or degrading cyclic di-GMP. Cyclic di-GMP is synthesized by proteins with diguanylate cyclase activity. These proteins typically have a characteristic GGDEF motif, which refers to a conserved sequence of five amino acids. Degradation of cyclic di-GMP is effected by proteins with phosphodiesterase activity. These proteins have either an EAL or an HD-GYP amino acid motif. Processes that are known to be regulated using cyclic di-GMP, at least in some organisms, include biofilm formation, motility and induction of virulence factors.Cyclic di-GMP levels are regulated using a variety of mechanisms. Many proteins with GGDEF, EAL or HD-GYP domains are found with other domains that can receive signals, such as PAS domains. Enzymes that degrade or synthesize cyclic di-GMP are believed to be localized to specific regions of the cell, where they influence receivers in a restricted space. In Gluconacetobacter xylinus c-di-GMP stimulates the polymerization of glucose into cellulose as a high affinity allosteric activator of the enzyme cellulose synthase. Some diguanylate cyclase enzymes are allosterically inhibited by cyclic di-GMP. Cyclic di-GMP levels regulate other processes via a number of mechanisms. The Gluconacetobacter xylinus cellulose synthase is allosterically stimulated by cyclic di-GMP, presenting a mechanism by which cyclic di-GMP can regulate cellulose synthase activity. The PilZ domain has been shown to bind cyclic di-GMP and is believed to be involved in cyclic di-GMP-dependent regulation, but the mechanism by which it does this is unknown. Recent structural studies of PilZ domains from two bacterial species have demonstrated that PilZ domains change conformation drastically upon binding to cyclic di-GMP. This leads to the strong inference that conformational changes in PilZ domains allow the activity of targeted effector proteins (such as cellulose synthase) to be regulated by cyclic di-GMP. Riboswitches called the cyclic di-GMP-I riboswitch and cyclic di-GMP-II riboswitch regulate gene expression in response to cyclic di-GMP concentrations in a variety of bacteria, but not all bacteria that are known to use cyclic di-GMP.
  • Cyclisch diguanylaat of c-di-GMP is een cyclisch nucleotide die dienst doet als secundaire boodschapper in de cel. Het wordt gebruikt voor intracellulaire signaaltransductie en komt voor in een groot aantal bacteriën. Cyclisch diguanylaat komt tot dusver bekend niet voor in cellen van eukaryoten en Archaea. De structuur kan worden opgevat als een dimeer van cyclisch guanosinemonofosfaat (cGMP).
dbpedia-owl:alternativeName
  • c-di-GMP
  • di-GMP cyclique, di-GMPc,
dbpedia-owl:depictionDescription
  • Structure de la di-guanosine monophosphate cyclique
  • 250px
dbpedia-owl:smiles
  • C1[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=NC4=C3NC(=NC4=O)N)O)OP(=O)(OCC5C([C@H]([C@@H](O5)N6C=NC7=C6NC(=NC7=O)N)O)OP(=O)(O1)O)O
dbpedia-owl:thumbnail
dbpedia-owl:wikiPageID
  • 5499221 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageLength
  • 9082 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageOutDegree
  • 38 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageRevisionID
  • 91882750 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageWikiLink
prop-fr:c
  • 20 (xsd:integer)
prop-fr:chebi
  • 49537 (xsd:integer)
prop-fr:h
  • 24 (xsd:integer)
prop-fr:legende
  • 250 (xsd:integer)
  • Structure de la di-guanosine monophosphate cyclique
prop-fr:n
  • 10 (xsd:integer)
prop-fr:nom
  • Di-guanosine monophosphate cyclique
prop-fr:o
  • 14 (xsd:integer)
prop-fr:p
  • 2 (xsd:integer)
prop-fr:smiles
  • C1[C@@H]2[C@H]OPO
prop-fr:stdinchi
  • 1 (xsd:integer)
prop-fr:stdinchikey
  • PKFDLKSEZWEFGL-WQKDRPCASA-N
prop-fr:synonymes
  • c-di-GMP
  • di-GMP cyclique, di-GMPc,
prop-fr:tailleimage
  • 200 (xsd:integer)
prop-fr:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
rdf:type
rdfs:comment
  • La di-guanosine monophosphate cyclique, également appelée diguanylate cyclique, est un second messager utilisé par de nombreuses bactéries, mais ne semble pas être utilisé par les archées ni par les eucaryotes. La structure de cette molécule correspond à un minuscule fragment d'ARN cyclique à deux résidus guanine, liés par deux résidus ribose-5-phosphate, formant un cycle à deux nucléotides.Chez les bactéries, certains signaux sont transmis en produisant ou en dégradant de la di-GMP cyclique.
  • Cyclisch diguanylaat of c-di-GMP is een cyclisch nucleotide die dienst doet als secundaire boodschapper in de cel. Het wordt gebruikt voor intracellulaire signaaltransductie en komt voor in een groot aantal bacteriën. Cyclisch diguanylaat komt tot dusver bekend niet voor in cellen van eukaryoten en Archaea. De structuur kan worden opgevat als een dimeer van cyclisch guanosinemonofosfaat (cGMP).
  • Cyclic di-GMP (also called cyclic diguanylate and c-di-GMP) is a second messenger used in signal transduction in a wide variety of bacteria. Cyclic di-GMP is not known to be used by eukaryotes or archaea.
rdfs:label
  • Di-guanosine monophosphate cyclique
  • Cyclic di-GMP
  • Cyclisch diguanylaat
owl:sameAs
http://www.w3.org/ns/prov#wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
foaf:name
  • Di-guanosine monophosphate cyclique
is dbpedia-owl:wikiPageRedirects of
is dbpedia-owl:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of