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Le génome mitochondrial humain désigne le matériel génétique des mitochondries, propre à l'espèce humaine. En génétique des populations et en théorie de l'évolution, ce génome est particulièrement étudié, car il permet de remonter des lignées féminines puisqu'il n'est transmis que par la mère (contrairement au chromosome Y humain qui n'est transmis quasiment que par les pères) Ce génome est particulièrement étudié en médecine, notamment dans le cadre des maladies génétiques, car il permet de retracer l'origine familiale d'une maladie.
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