La saison 2012-2013 de l'Olympique de Marseille est la quatre-vingt-unième de l'histoire du club sous l'ère du professionnalisme. Elle débute alors que l'OM a remporté deux trophées : celui de la Coupe de la Ligue contre Lyon et le Trophée des champions face à Lille. Didier Deschamps est remplacé par Élie Baup à la tête de l'équipe. Le club est par ailleurs engagé dans trois autres compétitions que sont les deux coupes nationales et la Ligue Europa.