La présidence portugaise du Conseil de l'Union européenne en 2000 désigne la deuxième présidence du Conseil de l'Union européenne effectuée par le Portugal depuis son adhésion à l'Union européenne en 1986. Elle fait suite à la présidence finlandaise de 1999 et précède celle de la présidence française du Conseil de l'Union européenne à partir du 1er juillet 2000.
