L'ordre de bataille confédéré d'Antietam présente les unités et commandants de l'armée des États confédérés qui ont combattu lors de la bataille d'Antietam de la guerre de Sécession. L'ordre de bataille unioniste d'Antietam est indiqué séparément ainsi qu'un ordre de bataille global au niveau de la brigade. L'ordre de bataille est compilé à partir de l'organisation de l'armée au cours de la campagne, des décomptes des victimes et des rapports.