La liste des espèces protégées en Auvergne est une liste officielle définie par le gouvernement français, recensant les espèces végétales qui sont protégées sur le territoire de la région Auvergne, en complément de celles qui sont déjà protégées sur le territoire métropolitain. Elle a été publiée dans un arrêté du 30 mars 1990 (modifiée le 10 mai 1990).