La Coupe de l'EHF 2005-2006 est la 25e édition de la Coupe de l'EHF masculine. Organisée par la Fédération européenne de handball (EHF), la compétition est ouverte en 2005-2006 à 56 clubs de handball d'associations membres de l'EHF. Ces clubs sont qualifiés en fonction de leurs résultats dans leur pays d'origine lors de la saison 2004-2005.