La Coupe d’Afrique des nations des moins de 17 ans 1999 est un tournoi de football organisé par la Confédération africaine de football (CAF). Elle se déroule tous les deux ans et oppose les meilleures sélections africaines des moins de 17 ans. L'édition 1999 a eu lieu en Guinée du 16 mai au 30 mai 1999 et a vu la victoire du Ghana face au Burkina Faso sur le score final de trois buts à un.