La Liga Nacional 1968-1969 est la dix-septième édition de la première division guatémaltèque. Lors de ce tournoi, le Aurora FC a tenté de conserver son titre de champion du Guatemala face aux neuf meilleurs clubs guatémaltèques. Chacun des dix clubs participant était confronté trois fois aux neuf autres équipes. Seulement une place était qualificative pour la Coupe des champions de la CONCACAF.