La saison 2009-2010 de League Two est la cinquante-deuxième édition de la quatrième division anglaise. Le championnat est remporté par Notts County. Les vingt-quatre clubs participants au championnat sont confrontés à deux reprises aux vingt-trois autres. À la fin de la saison, les trois premiers sont promus en League One et les quatre suivants s'affrontent en barrages. Les deux derniers sont quant à eux relégués en Conférence National.