Le championnat d'Algérie de football 1998-1999 est la 35e édition du championnat d'Algérie de football. Cette édition se déroule en deux poules de 14 équipes dont les vainqueurs s'affrontent en finale pour déterminer le champion d'Algérie. Le MC Alger remporte le titre de champion d'Algérie en battant en finale la JS Kabylie.