La 13e étape du Tour d'Italie 2004 a eu lieu le 22 mai 2004 autour de la ville de Trieste sur une distance de 52 km et sous la forme d'un contre-la-montre individuel. Elle a été remportée par l'Ukrainien Serhiy Honchar (De Nardi-Piemme Telekom). Il devance l'Australien Bradley McGee (Fdjeux.com) de dix-huit secondes et son compatriote Yaroslav Popovych (Landbouwkrediet-Colnago). Popovych s'empare à cette occasion du maillot rose de leader au détriment de l'Italien Damiano Cunego (Saeco).