Le FC Saint-Gall joue pour la saison 2009-2010 en Axpo Super League, la première division suisse, après avoir joué en Challenge League la saison précédente.L'équipe entraînée par l'Italien Uli Forte se maintient parmi l'élite avec une sixième place à l'issue de la saison avec 46 points. Le FC Saint-Gall parvient à atteindre le stade des demi-finales de la Coupe de Suisse de football 2009-2010, où il est éliminé par le FC Lausanne-Sport.