Le séquençage des protéines est la détermination de la séquence polypeptidique. Elle est destinée à connaître le nombre, la nature chimique et l'ordre de tous les résidus d'acides aminés dans un polypeptide. Pour cela, si la protéine contient plus d'une chaîne polypeptidique, les chaînes doivent être d'abord séparées, puis purifiées. Généralement, toutes les liaisons disulfures seront réduites et les thiols ainsi obtenus alkylés.

PropertyValue
dbpedia-owl:abstract
  • Le séquençage des protéines est la détermination de la séquence polypeptidique. Elle est destinée à connaître le nombre, la nature chimique et l'ordre de tous les résidus d'acides aminés dans un polypeptide. Pour cela, si la protéine contient plus d'une chaîne polypeptidique, les chaînes doivent être d'abord séparées, puis purifiées. Généralement, toutes les liaisons disulfures seront réduites et les thiols ainsi obtenus alkylés. Après isolement d'une chaîne polypeptidique, la séquence peut être étudiée: en faisant appel à des méthodes récurrentes chimiques ou enzymatiques libérant les acides aminés un à un à partir de l'extrémité C ou N terminale; ou plus récemment par des méthodes de spectrométrie de masse (séquençage de novo). Le séquencage des protéines est plus difficile que celui de l'ADN.
  • Protein sequencing is a technique to determine the amino acid sequence of a protein, as well as which conformation the protein adopts and the extent to which it is complexed with any non-peptide molecules. Discovering the structures and functions of proteins in living organisms is an important tool for understanding cellular processes, and allows drugs that target specific metabolic pathways to be invented more easily. The two major direct methods of protein sequencing are mass spectrometry and the Edman degradation reaction. It is also possible to generate an amino acid sequence from the DNA or mRNA sequence encoding the protein, if this is known. However, there are many other reactions that can be used to gain more limited information about protein sequences and can be used as preliminaries to the aforementioned methods of sequencing or to overcome specific inadequacies within them.
  • Sekwencjonowanie białka – ustalenie sekwencji aminokwasów w łańcuchu peptydowym białka. Najstarszą, wciąż stosowaną metodą sekwencjonowania białek jest degradacja Edmana. Polega ona na wykorzystaniu specyficzności izotiocyjanku fenylu do wolnej grupy aminowej łańcucha peptydowego. Powstały w tej reakcji karbamyl, w warunkach kwaśnych, rozpada się na pochodną fenylotiohydantoniową N-terminalnego aminokwasu i polipeptyd pozbawiony końcowego aminokwasu. Reakcję tę można przeprowadzać cyklicznie, za każdym razem analizując produkty reakcji chromatograficznie. W praktyce trudno jest zsekwencjonować w ten sposób więcej niż 10 aminokwasów, ze względu na brak 100% wydajności tej reakcji. Z tego powodu analizuje się sekwencję peptydów będących produktami trawień proteolitycznych badanego białka. Metoda ta jest żmudna, pracochłonna i wymaga dużych ilości oczyszczonego białka. Z powodu tych niedogodności, degradacja Edmana została zastąpiona obecnie analizą jonów peptydowych metodą spektrometrii mas.Do określania sekwencji wykorzystuje się tandemowe spektrometry mas, które pozwalają na wyselekcjonowanie jonów peptydowych, ich fragmentację i pomiar mas molowych powstałych fragmentów. Fragmentacja polipeptydu zachodzi najczęściej przy wiązaniach peptydowych, dzięki czemu dane o masach fragmentów pozwalają na ustalenie sekwencji aminokwasowej peptydów. Podczas sekwencjonowania peptydu w spektrometrze mas nie można odróżnić aminokwasów: leucyny od izoleucyny oraz lizyny od glutaminy. Leucyna i izoleucyna mają identyczne masy molowe, gdyż są swoimi izomerami. Lizyna i glutamina pomimo innego składu pierwiastkowego mają bardzo podobne masy. Metoda sekwencjonowania w spektrometrze mas pozwala na określenie sekwencji aminokwasowej peptydów o długości do około 30 aminokwasów. Polipeptydy występujące w naturze charakteryzują się zwykle większą długością - kilkadziesiąt aminokwasów do kilku tysięcy aminokwasów. Białka są często zbudowane z więcej niż jednego łańcucha polipeptydowego. Problem ich analizy jest rozwiązywany przez trawienie białka proteazą i sekwencjonowanie powstałych w ten sposób krótkich oligopeptydów.
  • Sequenciação de proteínas é a determinação das sequências de aminoácidos que constituem um péptido; e também a determinação da conformação que adopta e se é complexado com outras moléculas não-péptidas. Descobrir as estruturas e funções de proteínas em organismos vivos é uma ferramenta importante para a compreensão dos processos celulares e permite que sejam mais facilmente desenhados medicamentos que atinjam vias metabólicas específicas.Os dois principais métodos directos de sequenciação de proteínas são espectrometria de massa e a reacção de degradação de Edman. Também é possível gerar uma sequência de aminoácidos a partir de uma sequência de DNA ou mRNA que codifiquem a proteína, se esta for conhecida. Há também uma série de outras reacções que podem ser usadas para ganhar informação mais limitada sobre as sequências das proteínas e que podem ser usadas preliminarmente aos métodos já referidos ou para ultrapassar limitações específicas desse métodos.
  • Die Proteinsequenzierung bezeichnet biochemische Methoden zur Bestimmung der Aminosäuresequenz von Proteinen oder Peptiden.
dbpedia-owl:wikiPageID
  • 804507 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageLength
  • 15587 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageOutDegree
  • 141 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageRevisionID
  • 110461186 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageWikiLink
prop-fr:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
rdfs:comment
  • Le séquençage des protéines est la détermination de la séquence polypeptidique. Elle est destinée à connaître le nombre, la nature chimique et l'ordre de tous les résidus d'acides aminés dans un polypeptide. Pour cela, si la protéine contient plus d'une chaîne polypeptidique, les chaînes doivent être d'abord séparées, puis purifiées. Généralement, toutes les liaisons disulfures seront réduites et les thiols ainsi obtenus alkylés.
  • Die Proteinsequenzierung bezeichnet biochemische Methoden zur Bestimmung der Aminosäuresequenz von Proteinen oder Peptiden.
  • Sequenciação de proteínas é a determinação das sequências de aminoácidos que constituem um péptido; e também a determinação da conformação que adopta e se é complexado com outras moléculas não-péptidas.
  • Protein sequencing is a technique to determine the amino acid sequence of a protein, as well as which conformation the protein adopts and the extent to which it is complexed with any non-peptide molecules. Discovering the structures and functions of proteins in living organisms is an important tool for understanding cellular processes, and allows drugs that target specific metabolic pathways to be invented more easily.
  • Sekwencjonowanie białka – ustalenie sekwencji aminokwasów w łańcuchu peptydowym białka. Najstarszą, wciąż stosowaną metodą sekwencjonowania białek jest degradacja Edmana. Polega ona na wykorzystaniu specyficzności izotiocyjanku fenylu do wolnej grupy aminowej łańcucha peptydowego. Powstały w tej reakcji karbamyl, w warunkach kwaśnych, rozpada się na pochodną fenylotiohydantoniową N-terminalnego aminokwasu i polipeptyd pozbawiony końcowego aminokwasu.
rdfs:label
  • Séquençage des protéines
  • Protein sequencing
  • Proteinsequenzierung
  • Sekwencjonowanie białka
  • Sequenciação de proteínas
owl:sameAs
http://www.w3.org/ns/prov#wasDerivedFrom
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbpedia-owl:wikiPageRedirects of
is dbpedia-owl:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of