La 39e édition de Cholet-Pays de Loire a eu lieu le 20 mars 2016. La course fait partie du calendrier UCI Europe Tour 2016 en catégorie 1.1. C'est également la troisième épreuve de la Coupe de France de cyclisme sur route 2016. L'épreuve a été remportée lors d'un sprint d'une vingtaine de coureurs par le Français Rudy Barbier (Roubaix Métropole européenne de Lille) qui s'impose respectivement devant le Belge Baptiste Planckaert (Wallonie Bruxelles-Group Protect) et son compatriote Yannis Yssaad (Armée de Terre).