Le Championnat du monde de Supersport 2006 est la 8e édition du Championnat du monde de Supersport.La saison a débuté le 25 février et s'est terminée le 8 octobre après 12 manches. Sébastien Charpentier a remporté son deuxième titre pilote d'affilée avec un total de six courses gagnées et Honda le titre constructeur.