Dans le cadre de la mécanique moléculaire, un champ de force est un ensemble de potentiels et de paramètres permettant de décrire la structure de l'énergie potentielle d'un système de particules (typiquement, des atomes, mais non exclusivement). L'usage de l'expression champ de force en chimie et biologie numériques diffère ainsi de celui de la physique, où il indique en général un gradient négatif d'un potentiel scalaire.

PropertyValue
dbpedia-owl:abstract
  • Dans le cadre de la mécanique moléculaire, un champ de force est un ensemble de potentiels et de paramètres permettant de décrire la structure de l'énergie potentielle d'un système de particules (typiquement, des atomes, mais non exclusivement). L'usage de l'expression champ de force en chimie et biologie numériques diffère ainsi de celui de la physique, où il indique en général un gradient négatif d'un potentiel scalaire. Les potentiels et paramètres d'un champ de force donné sont déterminés à partir de résultats expérimentaux et de calculs précis en mécanique quantique. Un champ de force est, en général, construit et utilisé dans le cadre de l'approximation de Born-Oppenheimer.Il existe, en fonction des systèmes étudiés, de nombreux champs de force différents. Les champs de force tout-atome (all atom) donnent des paramètres pour tous les atomes du système, y compris l'hydrogène, alors que les champs de force atomes unifiés (unified atom) ne prennent pas en compte les atomes d'hydrogène sauf si ces derniers sont polaires (H est traité comme un centre d'interaction). Les champs de force basés sur les atomes lourds ne prennent pas du tout en compte les atomes d'hydrogène. Certains champs de force sont basés sur des modèles simplifiés de tout ou partie d'un ou plusieurs objets comme, par exemple, les champs à gros grains (coarse grained) fréquemment utilisés dans les simulations longues de protéines, ou les champs basés sur des grilles et réseaux (in lattice).Le choix d'un champ, spécifique d'un système et plus ou moins efficace, dépend des études que l'on doit produire et des propriétés recherchées.
  • En modelat molecular, un camp de forces fa referència a la forma i els paràmetres de funcions matemàtiques que s'utilitzen per a descriure l'energia potencial d'un sistema de partícules.
  • In the context of molecular modeling, a force field refers to the form and parameters of mathematical functions used to describe the potential energy of a system of particles (typically molecules and atoms). Force field functions and parameter sets are derived from both experimental work and high-level quantum mechanical calculations. "All-atom" force fields provide parameters for every type of atom in a system, including hydrogen, while "united-atom" force fields treat the hydrogen and carbon atoms in each terminal methyl and each methylene bridge as a single interaction center. "Coarse-grained" force fields, which are frequently used in long-time simulations of proteins, provide even more crude representations for increased computational efficiency.The usage of the term "force field" in chemistry and computational biology differs from the standard usage in physics. In chemistry it is a system of potential energy functions rather than the gradient of a scalar potential, as defined in physics.
  • W fizyce i chemii obliczeniowej pole siłowe to termin oznaczający zarówno funkcję, jak i zestaw parametrów mających na celu opisanie energii potencjalnej układu atomów lub cząsteczek. Zwykle termin ten pojawia się w kontekście dynamiki molekularnej oraz mechaniki molekularnej, gdzie odgrywa niezbędną rolę jako przybliżenia rzeczywistej funkcji potencjału. Do czasów obecnych opracowano bardzo wiele różnych pól siłowych. Niektóre z nich mają szerokie zastosowanie w prowadzeniu symulacji wielu różnych układów molekularnych (np. CHARMM, AMBER), podczas gdy inne zostały zoptymalizowane do prowadzenia wyspecjalizowanych obliczeń (np. OPLS).Funkcje i parametry budujące pola siłowe wywodzą się zarówno z pomiarów eksperymentalnych, jak i zaawansowanych obliczeń kwantowomechanicznych. Pełnoatomowe pola siłowe zapewniają parametry do opisu każdego atomu w analizowanym układzie podczas gdy metody wykorzystujące „atomy zjednoczone” opisują niektóre grupy funkcyjne takie jak metyl oraz metylen w sposób przybliżony, traktując je jako pojedyncze atomy. Natomiast „gruboziarniste” pola siłowe (ang. coarse-grained force fields) stosowane w długich czasowo symulacjach białek i kwasów nukleinowych dążą do jeszcze bardziej uproszczonego opisu cząsteczek, wprowadzając pseudoatomy symulujące zachowanie całych reszt aminokwasowych (białka), bądź zasad azotowych (kwasy nukleinowe). Takie przybliżenia są konieczne z uwagi na znaczny koszt obliczeniowy modelowania tak dużych układów molekularnych.Należy podkreślić, że termin pole siłowe jest obecnie inaczej rozumiany w chemii i biologii obliczeniowej niż w fizyce. Chemiczne pole siłowe stanowi przybliżenie funkcji obrazującej energię potencjalną cząsteczki podczas gdy w fizyce określenie to jest zarezerwowane do opisu gradientu pola skalarnego
  • Nell'ambito della meccanica molecolare, un Force field si riferisce alla forma funzionale ed al set di parametri utilizzati per esprimere l'energia potenziale di un sistema di particelle (solitamente, ma non necessariamente, atomi). Le funzioni del Force field ed i set di parametri sono derivati sia da dati sperimentali che da calcoli quantomeccanici ab initio di alto livello. Esistono varie tipologie di Force field: gli "all-atom" hanno parametri per ogni atomo costituente il sistema, mentre gli "united-atom" trattano gli atomi di idrogeno e quelli di carbonio appartenenti a gruppi metile e metilene come un singolo centro di interazione. Infine i Force field "Coarse-grained", spesso utilizzati nelle simulazioni per lunghi tempi di proteine, utilizzano rappresentazioni ancora più astratte per poter aumentare l'efficienza computazionale.In chimica e biologia computazionale il significato del termine "Force field" differisce da quello che ha in fisica. Infatti mentre in ambito chimico e biologico rappresenta una funzione potenziale, in fisica è utilizzato per esprimere il gradiente negativo di un potenziale scalare.
dbpedia-owl:thumbnail
dbpedia-owl:wikiPageExternalLink
dbpedia-owl:wikiPageID
  • 4230658 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageLength
  • 31281 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageOutDegree
  • 113 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageRevisionID
  • 99021787 (xsd:integer)
dbpedia-owl:wikiPageWikiLink
prop-fr:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
rdfs:comment
  • Dans le cadre de la mécanique moléculaire, un champ de force est un ensemble de potentiels et de paramètres permettant de décrire la structure de l'énergie potentielle d'un système de particules (typiquement, des atomes, mais non exclusivement). L'usage de l'expression champ de force en chimie et biologie numériques diffère ainsi de celui de la physique, où il indique en général un gradient négatif d'un potentiel scalaire.
  • En modelat molecular, un camp de forces fa referència a la forma i els paràmetres de funcions matemàtiques que s'utilitzen per a descriure l'energia potencial d'un sistema de partícules.
  • Nell'ambito della meccanica molecolare, un Force field si riferisce alla forma funzionale ed al set di parametri utilizzati per esprimere l'energia potenziale di un sistema di particelle (solitamente, ma non necessariamente, atomi). Le funzioni del Force field ed i set di parametri sono derivati sia da dati sperimentali che da calcoli quantomeccanici ab initio di alto livello.
  • In the context of molecular modeling, a force field refers to the form and parameters of mathematical functions used to describe the potential energy of a system of particles (typically molecules and atoms). Force field functions and parameter sets are derived from both experimental work and high-level quantum mechanical calculations.
  • W fizyce i chemii obliczeniowej pole siłowe to termin oznaczający zarówno funkcję, jak i zestaw parametrów mających na celu opisanie energii potencjalnej układu atomów lub cząsteczek. Zwykle termin ten pojawia się w kontekście dynamiki molekularnej oraz mechaniki molekularnej, gdzie odgrywa niezbędną rolę jako przybliżenia rzeczywistej funkcji potencjału. Do czasów obecnych opracowano bardzo wiele różnych pól siłowych.
rdfs:label
  • Champ de force (chimie)
  • Camp de forces (química)
  • Force field
  • Force field (chemistry)
  • Krachtveld
  • Kraftfeld (Computerphysik)
  • Pole siłowe
owl:sameAs
http://www.w3.org/ns/prov#wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbpedia-owl:wikiPageDisambiguates of
is dbpedia-owl:wikiPageRedirects of
is dbpedia-owl:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of