Un élément SECIS, de l'anglais selenocysteine insertion structure, est un élément cis-régulateur d'ARN messager long d'une soixantaine de nucléotides caractérisé par sa forme en épingle à cheveux, ou « tige-boucle ». Cette structure tridimensionnelle particulière conduit les ribosomes à traduire le codon UGA par un acide aminé, la sélénocystéine, alors qu'il s'agit normalement du codon-STOP Opale dans le code génétique.

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  • Un élément SECIS, de l'anglais selenocysteine insertion structure, est un élément cis-régulateur d'ARN messager long d'une soixantaine de nucléotides caractérisé par sa forme en épingle à cheveux, ou « tige-boucle ». Cette structure tridimensionnelle particulière conduit les ribosomes à traduire le codon UGA par un acide aminé, la sélénocystéine, alors qu'il s'agit normalement du codon-STOP Opale dans le code génétique. Les éléments SECIS sont donc indispensables à la synthèse des sélénoprotéines, essentiellement des enzymes de la famille des oxydo-réductases.Chez les bactéries, les éléments SECIS apparaissent peu après les codons UGA dont ils altèrent la traduction. Chez les archées et chez les eucaryotes, ils se trouvent dans la région 3'-terminale des ARN messagers et peuvent affecter le sens de plusieurs codons UGA. L'un de ces éléments SECIS se trouve dans la région 5'-terminale chez Methanococcus, du phylum des Euryarchaeota.La structure secondaire particulière des éléments SECIS découle d'une séquence de bases nucléiques présentant certaines caractéristiques distinctives autorisant cette configuration spatiale déterminante, notamment des appariements atypiques entre paires de bases puriques — guanine et adénine — qui sont essentiels au bon fonctionnement de l'élément SECIS.
  • In biology, the SECIS element (SECIS: selenocysteine insertion sequence) is an RNA element around 60 nucleotides in length that adopts a stem-loop structure. This structural motif (pattern of nucleotides) directs the cell to translate UGA codons as selenocysteines. (UGA is normally a stop codon.) SECIS elements are thus a fundamental aspect of messenger RNAs encoding selenoproteins, proteins that include one or more selenocysteine residues.In bacteria the SECIS element appears soon after the UGA codon it affects. In archaea and eukaryotes, it occurs in the 3' UTR of an mRNA, and can cause multiple UGA codons within the mRNA to code for selenocysteine. One archaeal SECIS element, in Methanococcus, is located in the 5' UTR.[citation needed]The SECIS element appears defined by sequence characteristics, i.e. particular nucleotides tend to be at particular positions in it, and a characteristic secondary structure. The secondary structure is the result of base-pairing of complementary RNA nucleotides, and causes a hairpin-like structure. The eukaryotic SECIS element includes non-canonical A-G base pairs, which are uncommon in nature, but are critically important for correct SECIS element function. Although the eukaryotic, archaeal and bacterial SECIS elements each share a general hairpin structure, they are not alignable, e.g. an alignment-based scheme to recognize eukaryotic SECIS elements will not be able to recognize archaeal SECIS elements.In bioinformatics, several computer programs have been created that search for SECIS elements within a genome sequence, based on the sequence and secondary structure characteristics of SECIS elements. These programs have been used in searches for novel selenoproteins.
  • En biologia, l'Element SECIS (de l'anglès, SECIS: selenocysteine insertion sequence) és un motiu estructural (o seqüència de nucleòtids) del RNA missatger que fa que, davant la presència d'un codó UGA, la cèl·lula insereixi una selenocisteïna a la seqüència proteica que s'estigui traduint. El codó UGA, sense la presència de l'Element SECIS, fa que s'aturi la traducció.En Eubacteria l'Element SECIS es troba poc després del codó UGA. En canvi, en archea i eucariotes, aquest element es troba en el segment 3'UTR de l'RNA missatger i pot afectar, en aquest cas, a més d'un codó UGA.L'element SECIS està definit per unes seqüències característiques (nucleòtids situats en llocs concrets) i per una característica estructura secundària. Aquesta estructura secundària és fruit de l'aparellament de bases del RNA missatges. En eucariotes, l'element SECIS conté aparellament de bases no canònics A-G, gens comuns en la natura i que són crítics per a la funció d'aquest element.En el camp de la bioinformàtica s'han desenvolupat molts programes per buscar l'element SECIS en les seqüències del genoma. Aquests programes se solen fer servir per identificar selenoproteïnes.
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  • Un élément SECIS, de l'anglais selenocysteine insertion structure, est un élément cis-régulateur d'ARN messager long d'une soixantaine de nucléotides caractérisé par sa forme en épingle à cheveux, ou « tige-boucle ». Cette structure tridimensionnelle particulière conduit les ribosomes à traduire le codon UGA par un acide aminé, la sélénocystéine, alors qu'il s'agit normalement du codon-STOP Opale dans le code génétique.
  • En biologia, l'Element SECIS (de l'anglès, SECIS: selenocysteine insertion sequence) és un motiu estructural (o seqüència de nucleòtids) del RNA missatger que fa que, davant la presència d'un codó UGA, la cèl·lula insereixi una selenocisteïna a la seqüència proteica que s'estigui traduint. El codó UGA, sense la presència de l'Element SECIS, fa que s'aturi la traducció.En Eubacteria l'Element SECIS es troba poc després del codó UGA.
  • In biology, the SECIS element (SECIS: selenocysteine insertion sequence) is an RNA element around 60 nucleotides in length that adopts a stem-loop structure. This structural motif (pattern of nucleotides) directs the cell to translate UGA codons as selenocysteines.
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  • Élément SECIS
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